Издательство "Бакинский Университет" начало свою деятельность как редакционно-издательский отдел при Бакинском Государственном Университете, с которым связано исторически.
Общественно-политические процессы 20-30-х годов прошлого столетия, трудности довоенных и послевоенных годов сыграли немаловажную роль в деятельности издательства "Бакинский Университет".
Первые периодичные печатные издания БГУ были журналы «Вестник»(1921) и «Теоретическая и практическая медицина»(1924).
В 1921 году вышли в свет два полутомника «Вестников Бакинского Университета». Первый полутомник посвящен естествознанию и медицине, а второй - гуманитарным наукам. В 1922 году был выпущен второй номер «Вестников Бакинского Университета», а также первый полутомник (естествознание и медицина).
Деятельность по разным объективным и субъективным причинам неоднократно приостановливалась, но по требованию интеллигенции возобновлялась. Деятельность издательства Университета в 1961 году была в очередной раз приостановлена. Но во всей республике уже были знакомы книги с грифом Бакинского Университета.
С 1961 года издательство, как и раньше, продолжило издание научных новестей, учебных программ, исторических указаний, монографий малого объема.
В целях улучшения подготовки высококвалифицированных специалистов в республике, обеспечения их учебниками, учебными пособиями, научной литературой и другой продукцией, и принимая во внимание предложения Министерства Высших учебных заведений Государственного Комитета Издательства и Полиграфии, а также Комитета по делам книжной торговли Совета Министров Азербайджанской Республики, постановлением 24 (№1) от 24 января 1984 года приняло решение о создании нового издательства и типографии университета, на базе действующего редакционно-издательского отдела и типографии, которые находились в старом здании университета (ул. Коммунистическая, 6).
Но это здание было непригодным для дальнейшего использования. И поэтому было принято решение выделить издательству и типографии помещение в новом университетском корпусе: типографии - цокольную часть здания, а издательству - второй этаж.
С целью создания образцового издательства и типографии, отвечающим всем современным требованиям, необходимо было оснастить ее новейшей полиграфической техникой и оборудованием. Однако создание материально-технической базы нового издательства и ее типографии порой затруднялось объективными причинами.
Так как в 1985 году в университетском издательстве было 3 полиграфических машин и этими машинами в какой-то степени возможно было удовлетворить потребности ученых печатным продукциям, но увы издательство университета не могло расширить свою деятельность. Для основательной деятельности, в первую очередь, нужна была полиграфическая база, отвечающая современным требованиям.
Постановлением от 13 марта 1987 года ЦК КПСС и Совета Министров СССР «О мерах по коренному улучшению качества подготовки и использования специалистов с высшим образованием в народном хозяйстве» выдвигались задания о создании новых издательств всесоюзного и республиканского знаний, а также реорганизации существующих издательств.
В те годы в СССР были открыты 10 издательств, одно из них - Издательство "Бакинский Университет" (Издательство Азербайджанского Государственного Университета).
На основании этого постановления руководство республики и Министерство Образования в мае 1987 года на коллегии сделали решительные шаги. ЦК КП Азербайджана и Совет Министров Азербайджанской Республики приняли постановление улучшить рабочую структуру и деятельность издательства "Бакинский Университет", которое уже считалось одним из издательств II категории среди 10-ти издательств бывшего Союза. Следует отметить, что издательство «Бакинский Университет» являлось единственным издательством в области системы образования, которое имело свою типографию.
1980-х годах в издательстве «Бакы Университети» впервые было создано компьютерное бюро, сделаны шаги по офсетной печати. Начиная с 1988 года учебные издания, которые охватывают разные темы, впервые на азербайджанском языке были изданы в издательстве «Бакинский Университет», «Истоки по истории Азербайджана», «История Бакинского Университета», «Введение в специальность», «География арабских стран», «Уголовное право», «Семейное право», «Морфология языков орхоно-енисейских памятников», «Турецкий язык», «Исторический, географический и экономический Азербайджан», «Квантовая механика» (в задачах), «Типография с основанием геодезии», «Основы биотехнологии», «Чудо-система» и др.
Печатная продукция издательства «Бакы Университети» в значительной степени отличалась от продукций других идентичных издательств. Со времени создания издательство «Бакы Университети» и его типографию возглавляли: Фархад Зейналов, Аждар Бабазаде, Адиль Абдуллаев, Абузар Исмаилов, Агамуса Зейналов, Бахрам Джафаров, Керим Гасанов, Балакиши Агаев.